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            本學科組聚焦于但不僅限于被子植物及主要大類群的早期分化支系（如睡蓮目、毛茛目、山龍眼目、菖蒲目等），旨在通過追溯被子植物早期分化關鍵節(jié)點的基因組加倍、染色體重排等基因組演化事件，揭示被子植物及其主要大類群關鍵性狀的起源、演化范式與機制。同時，解析這些早期分支類群中如藥用次生代謝物等特有經(jīng)濟性狀的演化途徑與遺傳基礎，為相關類群的資源開發(fā)與利用提供科學依據(jù)。目前已發(fā)表SCI論文36篇，其中重要成果以第一或最后通訊作者發(fā)表在Nature Plants、Plant Cell、Genome Biology、Molecular Biology and Evolution、Plant Physiology、Plant Journal、Molecular Ecology、Journal of Integrative Plant Biology等期刊。
            研究組長
            


            


            		
姓 ? 名
石濤
學 ? 歷
博士
            

            
職 ? 稱
研究員
職 ? 務
博士生導師, PI
            

            
通訊地址
武漢市東湖新技術開發(fā)區(qū)九峰一路201號
            

            
郵政編碼
430074
電子郵箱
shitao323@wbgcas.cn
            


            
姓　名：
石濤
            

            
學 歷：
博士
            

            
職 稱：
研究員
            

            
職 務：
博士生導師, PI
            

            
通訊地址：
武漢市東湖新技術開發(fā)區(qū)九峰一路201號
            

            
郵政編碼：
430074
            

            
電子郵箱：
shitao323@wbgcas.cn
            簡要履歷
            


            
2007年本科畢業(yè)于華中農(nóng)業(yè)大學，2012年博士畢業(yè)于中國科學院大學/中國科學院武漢植物園。長期從事被子植物早期分支關鍵類群基因組演化與遺傳學研究。相關成果以第一或最后通訊作者發(fā)表在Nature Plants、Plant Cell等高水平期刊。獲得中國科學院青年促進會會員、湖北省青年拔尖人才、湖北省晨光計劃、國家自然科學基金面上、青年項目及湖北省自然科學基金青年項目等資助。并受邀擔任Plant Physiology、Plant Journal、Plant Biotechnology Journal等植物學領域重要期刊審稿人20余次，以及Plants、Genes的專刊編輯。
            研究組科研項目
            • 湖北省青年拔尖人才培養(yǎng)計劃，2024-01~2026-12，在研，主持（石濤）
            • 國家自然科學基金面上項目，32170240，轉(zhuǎn)座子微進化與基因組結(jié)構(gòu)變異對蓮兩生態(tài)型適應性作用機制研究，2022-01~2025-12，在研，主持（石濤）
            • 湖北省自然科學基金計劃青年項目，024AFB314，基于ATAC-seq與DNA甲基化測序探究染色質(zhì)可及性對蓮兩生態(tài)型適應性分化的作用機制，2024-07~2027-03（高志妍）
            • 國家自然科學基金青年科學基金項目，31700197，溫帶蓮與熱帶蓮雜交F1代的等位基因特異性表達研究，2018-01~2020-12，已結(jié)題，主持（石濤）
            • 中國科學院青年創(chuàng)新促進會會員，2019335，水生植物基因組學研究，2019-01~2022-12，已結(jié)題，主持（石濤）
            • 湖北省自然科學基金計劃青年項目，2019CFB275，全球野生蓮屬植物的遺傳與表型多樣性評價，2019-01~2020-12，已結(jié)題，主持（石濤）
            研究組代表成果
            代表性論文：
            1. Shi T, Huneau C, Zhang Y, Li Y, Chen JM*, Salse J*, Wang QF*. 2022. The slow-evolving Acorus tatarinowii genome sheds light on ancestral monocot evolution. Nature Plants, 8: 764-777.
            2. Shi T#*, Gao ZY#, Chen JM, Van de Peer Y*. 2024. Dosage sensitivity shapes balanced expression and gene longevity of homoeologs after whole-genome duplications in angiosperms, The Plant Cell, 36(10): 4323–4337.
            3. Shi T*, Chen JM*. 2020. A reappraisal of the phylogenetic placement of the Aquilegia whole-genome duplication. Genome Biology, 21: 295.
            4. Shi T, Rahmani RS, Gugger PF, Wang MH, Li H, Zhang Y, Li ZZ, Wang QF*, Peer YVd*, Marchal K*, Chen JM*. 2020. Distinct expression and methylation patterns for genes with different fates following a single whole-genome duplication in flowering plants. Molecular Biology and Evolution, 37(8): 2394-2413.
            5. Gao ZY, Yang XY, Chen JM*, Rausher MD*, Shi T*. 2023. Expression inheritance and constraints on cis- and trans-regulatory mutations underlying lotus color variation. Plant Physiology, 191(3): 1662-1683.
            6. Zhang Y, Yang XY, Peer YVd, Chen JM*, Marchal K*, Shi T*. 2022. Evolution of isoform-level gene expression patterns across tissues during lotus species divergence. The Plant Journal, 112(3): 830-846.
            7. Shi T, Wang K, Yang PF*. 2017. The evolution of plant microRNAs-insights from a basal eudicot sacred lotus. The Plant Journal, 89(3): 442-457.
            8. Li H, Yang XY, Wang QF, Chen JM*, Shi T*. 2021. Distinct methylome patterns contribute to ecotypic differentiation in the growth of the storage organ of a flowering plant (sacred lotus). Molecular Ecology, 30:2831–2845.
            9. Li H, Yang XY, Zhang Y, Gao ZY, Liang YT, Chen JM*, Shi T*. 2021. Nelumbo genome database, an integrative resource for gene expression and variants of Nelumbo nucifera. Scientific Data, 8: 38.
            10. Shi T, Huang HW, Sanderson MJ, Tax FE*. 2014. Evolutionary dynamics of leucine-rich repeat receptor-like kinases and related genes in plants: A phylogenomic approach. Journal of Integrative Plant Biology, 56(7): 648-662.
            專著：
            1. 《Underutilised Crop Genomes. Compendium of Plant Genomes》章節(jié)Advances and Prospects in Genomic and Functional Studies of the Aquatic Crop, Sacred Lotus，Springer, Cham出版社
            


            



            		
姓 ? 名
高志妍
學? 歷
博士
            

            
職 ? 務

            		
職 ? 稱
助理研究員
            

            
通訊地址
武漢市東湖新技術開發(fā)區(qū)九峰一路201號
            

            
郵政編碼
430074
電子郵箱
gaozhiyan@wbgcas.cn
            


            
姓　名：
高志妍
            

            
學 歷：
博士
            

            
職 稱：
助理研究員
            

            
職 務：

            

            
通訊地址：
武漢市東湖新技術開發(fā)區(qū)九峰一路201號
            

            
郵政編碼：
430074
            

            
電子郵箱：
gaozhiyan@wbgcas.cn
            簡要履歷
            2022年6月博士畢業(yè)于中國科學院武漢植物園，2023年2月入職武漢植物園。主要進行被子植物早期分支類群的微觀演化與遺傳學研究，重點關注蓮屬植物關鍵表型多樣化（蓮藕膨大、花色、花瓣瓣化等）的群體遺傳和順反式遺傳變異調(diào)控規(guī)律與機制。相關研究成果以第一作者或共同作者發(fā)表于The Plant Cell、Plant Physiology、Plant Molecular Biology、Frontiers in Plant Science等期刊。
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